אחת הסיבות בגינן המשפחה הישראלית מחליטה להתקין פרגולה היא על מנת להפוך את החלל האמור לחמים הרבה יותר: חשבו, למשל, על גינה ובה מימד לא מבוטל של פסטורליות. מהבחינה הזו, העץ הוא הבחירה האידיאלית, וזאת עקב האווירה החמימה, הפסטורלית והטבעית שהוא מעניק. בהמשך לכך, פשוט הרבה יותר להתאים את מראה הפרגולה לזה של הסביבה החיצונית המאפיינת אותה, התאמה אשר משפרת את המראה המתקבל עוד יותר. אם לוקחים מנגד פרגולת אלומיניום, לא תמיד זה פשוט להביא לכך שהן יעמדו בקנה אחד עם העיצוב המקיף אותן.
עץ מציע מידה רבה של גמישות כי הבנייה נעשית כחלק מבנייה קלה ללא שימושים של חומרים יקרים, כאשר מבחינה מעשית מדובר כאן על היכולת להתאים את הפרגולה לדרישות ולרצונות של בני הבית. זהו חומר גלם שפשוט עד מאד לעבד בצורות שונות, מה שמגדיל את האפשרויות עוד יותר. גם כאן, אפשר להתבונן מנגד על הליך העיבוד והעיצוב של האלומיניום, הנחשב למורכב יותר ולכן גם יקר יותר.
גם כאשר מתבוננים על ההיבט הכלכלי של ההצטיידות בפרגולה, פרגולות העשויות מעץ מגלמות בתוכן מספר מעלות. ראשית, העובדה היא שעלותן נחשבת לנמוכה בכל קנה מידה, כולל ביחס לפרגולות אלומיניום. המשמעות הישירה של כך היא שניתן להצטייד בסוג פופולארי זה של פרגולה, בלב שקט ומבלי להיכנס לבור כלכלי ממנו היציאה קשה.
גם לאורך זמן, מוכיחה עצמה התקנה של פרגולת עץ כמשתלמת ואחת הסיבות. כאשר העץ איכותי ועבר את ההליכים הנדרשים (למשל, אימפרגנציה להגנה מפני מזיקים לאורך זמן), הרי שהוא יישמר לאורך זמן מבלי שיש צורך לתקנו או להחליפו. גם התחזוקה עצמה הנדרשת מבני הבית היא מינימלית במקרה של פרגולות עץ.